世界上沒有兩片完全相同的葉子，也沒有兩個完全一樣的腫瘤!

幾年前，腫瘤的治療還停留在根據(jù)癌癥分類例如：肺癌，乳腺癌，肝癌，胃癌，結(jié)腸癌，直腸癌等進行治療，大多數(shù)患者雖然都有特別的腫瘤類型，但是他們大都被施以相同的化療方案。

隨著“精準醫(yī)學(xué)”時代的到來，迅速發(fā)展到了“量體裁衣”的個體化治療，而基因檢測，是精準醫(yī)學(xué)的核心部分。在歐美及日本癌癥的診斷及治療已經(jīng)進入全面的基因時代。一位患者患了癌癥，不僅要做病理診斷還要做全基因檢測，發(fā)現(xiàn)突變位點，進而為患者制定治療方案包括化療、突變點生物肽的制定及選擇，以及家族癌癥風險評估。

什么是癌癥基因?

癌細胞與正常細胞，有很多不同;其中，最重要的不同就是癌細胞中不少基因是變異的：有的基因缺失了，有的基因重復(fù)了，有的基因長歪了……

癌癥中可能發(fā)生許多類型的基因改變。四種主要類型包括：

1) 單核苷酸變異體(SNV)，也稱為點突變。SNV由一個堿基處的堿基置換產(chǎn)生。這些可能導(dǎo)致編碼蛋白的氨基酸序列(錯義突變)或蛋白過早截短(無義突變)。

2) 連續(xù)核苷酸的小復(fù)制，涉及一個或幾個核苷酸的插入或缺失，或涉及同時缺失和插入一個或幾個堿基(indelsa)的復(fù)雜突變。這些類型的突變可能是“框內(nèi)的”，導(dǎo)致蛋白質(zhì)中氨基酸的加入或減少，或可導(dǎo)致“移碼”，通常導(dǎo)致蛋白質(zhì)的過早截短。

3) 外顯子或基因拷貝數(shù)目的變化。外顯子拷貝數(shù)變化包括包含整個外顯子并影響蛋白質(zhì)功能結(jié)構(gòu)域的大的重復(fù)或缺失?；? 拷貝數(shù)變化包括整個基因的擴增或缺失。

4) 遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)變異(SV)或大的結(jié)構(gòu)異常，包括由多個染色體之間或單個染色體內(nèi)的斷點引起的易位或倒位。這些通常導(dǎo)致融合基因和相關(guān)融合蛋白。

通常，致癌突變聚集在來自不同患者的腫瘤的“熱點”突變。一些熱點SNV可能會頻繁發(fā)生，而另一些則很少見。例如，在所有黑素瘤中，40%發(fā)生BRAF V600E 突變，而BRAF L597S 突變的發(fā)生<1%。

什么是癌癥基因檢測?

我們都知道，癌癥是一種具有遺傳傾向的疾病，跟基因突變有著千絲萬縷的聯(lián)系，而這些基因在某些程度上，也決定了癌細胞的生長與分裂，并且這種突變也可能會遺傳。這時候就可以針對腫瘤的基因圖譜進行測試，從而確定到底是發(fā)生了哪些突變，而這個過程就叫做基因檢測。

在實際的治療過程中，基因檢測可以幫助醫(yī)生制定最佳的治療方案。比如：一些人患肺癌后，可以利用基因檢測的手段對癌細胞中的EGFR進行檢測，一旦發(fā)現(xiàn)了該突變，就可以利用對應(yīng)的靶向藥進行治療。再比如，有一些非常難以確診的腫瘤，需要依靠特定的基因改變協(xié)助確診。比如，不少肉瘤都長的像梭子一樣，長長扁扁的，這時候如果基因檢測發(fā)現(xiàn)有ASPL-TFE3融合基因，那診斷腺泡軟組織肉瘤，就八九不離十了。

利用各種方法，把這些變異的基因找出來，仔細分析，可以協(xié)助臨床診斷、指導(dǎo)治療選擇、輔助監(jiān)測疾病復(fù)發(fā)和耐藥、預(yù)估生存期等。

腫瘤基因測試范圍從簡單到復(fù)雜。最簡單的測試只檢測一種基因中的一種類型的突變。比如僅在BRAF位置c.1799處尋找特定T到A置換突變的試驗。

相反，最復(fù)雜的測試可以同時檢測所有主要類型的基因改變，包括替換，重復(fù)，插入，缺失，插入，基因拷貝數(shù) 變異和結(jié)構(gòu)變體，包括倒位和易位。

癌癥基因檢測的技術(shù)

等位基因特異性PCR

優(yōu)點：敏感性 - 需要突變存在1-5%。無需特殊設(shè)備。

缺點：目標特異性，無法檢測到可能存在于腫瘤DNA中的其他突變。

Sanger雙脫氧測序

優(yōu)點：可以檢測到各種未知的突變。如果首次從樣本中提取融合轉(zhuǎn)錄物的RNA，可用于檢測基因融合。無需特殊設(shè)備。

缺點：勞動強度大，需要突變DNA存在20-25%。無法檢測到外顯子或基因 拷貝數(shù)的變化。

焦磷酸測序

優(yōu)點：快速和靈敏地檢測5%水平的突變DNA。

缺點：需要焦磷酸測序儀器; 在可以在腫瘤DNA中檢測到的突變類型方面受到限制。

質(zhì)譜法

優(yōu)點：靈敏，存在5-10%可靠地檢測突變DNA; 測試多個基因。

缺點：需要質(zhì)譜儀器; SNV特異性并且不能檢測可能存在的腫瘤DNA中的其他突變。

單堿基擴展測定

優(yōu)點：靈敏，可靠地檢測突變DNA，如果以5-10%存在; 測試多個基因。無需特殊設(shè)備。

缺點： SNV特異性并且不能檢測可能存在于腫瘤DNA中的其他突變。

多重連接依賴性探針擴增 - MLPA

優(yōu)點：快速且能夠同時檢測多個突變。無需特殊設(shè)備?？梢詸z測到10%的目標SNV。

缺點：對于外顯子或基因 拷貝數(shù)變異檢測，需要突變DNA以20-40%的水平存在。靶向的SNV和外顯子和基因 拷貝數(shù)變體都是特異性的，并且不能檢測到腫瘤DNA中的其他突變。試劑盒可能不適用于感興趣的基因或突變。新鮮冰凍組織檢測效果優(yōu)于石蠟包埋組織提取DNA。

熒光原位雜交 - FISH

優(yōu)點：輕松檢測基因 拷貝數(shù)變化和有針對性的SV，這些SV不易被其他方法檢測到; 基于細胞的成像可以檢測一小部分細胞中的事件。

缺點：需要石蠟包埋組織未染色的切片; 無法檢測到實體瘤腫瘤中發(fā)生的大多數(shù)突變類型。

新一代測序-擴增捕獲

優(yōu)點：能夠同時檢測單個堿基替換以及更復(fù)雜的突變，包括單次測定中許多基因中的重復(fù)，插入，缺失和插入缺失; 需要少量的DNA。當測序到高“覆蓋深度”(1000x覆蓋率)時，測定對于檢測低豐度突變是敏感的。

缺點：昂貴; 需要一種完全不同于其他分子檢測方法的DNA制備方法。無法檢測基因 拷貝數(shù)變化和SV。

新一代測序 - 雜交捕獲

優(yōu)點：能夠同時檢測單個測定中許多基因中的替換，重復(fù)，插入，缺失，插入和外顯子和基因 拷貝數(shù)變化。探針也可以設(shè)計為捕獲經(jīng)常重新排列的基因中的選擇性易位斷點，如FoundationOne TM。

缺點：昂貴; 需要與傳統(tǒng)上用于其他分子突變測定的完全不同的DNA制備方法; 需要更多的腫瘤組織; 需要復(fù)雜的生物信息學(xué)。

新一代測序 - 全外顯子組測序

優(yōu)點：綜合性中等。在同一檢測中，可同時檢測許多基因中的替換，重復(fù)，插入，缺失，插入和外顯子和基因 拷貝數(shù)變化。

缺點：昂貴; 需要完全不同于傳統(tǒng)上用于其他分子突變檢測技術(shù)的DNA制備方法; 需要更多的腫瘤組織; 需要復(fù)雜的生物信息學(xué)。

新一代測序 - 全基因組測序

優(yōu)點：最全面?？赏瑫r檢測整個基因組中的替換，重復(fù)，插入，缺失，插入，基因和外顯子拷貝數(shù)變化以及染色體反轉(zhuǎn)和易位。

缺點：昂貴和低產(chǎn)量; 需要完全不同于傳統(tǒng)上用于大多數(shù)突變檢測技術(shù)的DNA制備方法; 需要更多的腫瘤組織; 需要復(fù)雜的生物信息學(xué); 對數(shù)據(jù)存儲和處理有巨大的計算需求。

數(shù)字PCR - ddPCR

優(yōu)點：高水平的敏感性和特異性; 相對便宜。

缺點：只能檢測已知的有針對性的突變 ; 受限于檢測到的突變類型; 每個測定只能檢測到有限數(shù)量的突變。

BEAMing技術(shù)

優(yōu)點：高度的敏感性和特異性

缺點：只能檢測已知的有針對性的突變 ; 受限于檢測到的突變類型; 每個測定只能檢測到有限數(shù)量的突變。

什么是基于基因檢測的靶向治療?

在惡性腫瘤的治療中，一個令人困惑的問題就是：同一分期、同一病理類型的惡性腫瘤患者，采用相同的治療方案，其療效(如生存期)為什么會存在明顯差異?

隨著人類基因組計劃的完成，研究人員發(fā)現(xiàn)同一類型腫瘤的細胞分子生物學(xué)差異可能是導(dǎo)致疾病個體化差異的原因所在，繼而發(fā)現(xiàn)了一些與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的基因，即腫瘤的“驅(qū)動基因”。肺癌已知的驅(qū)動基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET。驅(qū)動基因不同，患者對腫瘤的治療反應(yīng)也就不同，這就是相同分型、分期的腫瘤患者存在療效差異的原因。

目前一些藥物如靶向藥物具有特異性針對某種腫瘤基因突變達到精準殺傷的效果，而不同腫瘤患者腫瘤驅(qū)動基因突變存在差異，因此通過基因檢測，了解患者哪種基因發(fā)生突變，適合應(yīng)用哪種藥物，也就達到了“量體裁衣”的效果，做到了“精準醫(yī)療”。

比如，晚期肺腺癌病友，超過一半都攜帶EGFR、ALK、ROS-1等基因突變，這類病人就有機會嘗試靶向藥了，有效率高、副作用小、生存期相對較長。甚至有一些患者依靠一代一代的靶向藥聯(lián)合傳統(tǒng)放化療，生存期超過10年、20年的超級幸運案例。

基因檢測的方案有哪些?

看了上面的介紹，是不是感受到了基因檢測的極端復(fù)雜性——的確是這樣的，每個病人到底應(yīng)該做哪些基因的檢測，才能做到盡可能不遺漏(不錯過治療機會，不浪費標本)、又不多花冤枉錢，這里面學(xué)問很大很大……

對患者來說，真正關(guān)鍵的問題是檢測什么基因，目前醫(yī)院和各大基因檢測公司都有針對不同人群的各類套餐，總結(jié)如下：

1、單癌種小penel檢測：比如，對于肺癌患者，已知的驅(qū)動基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET，那么只檢測這些常見突變的基因就可以了。目前國內(nèi)權(quán)威的基因檢測公司如泛生子、世和都推出了針對不同癌種的檢測項目，如肺癌18基因、腦瘤63基因檢測等。

優(yōu)勢：價格便宜。拿肺癌舉例，由于中國肺腺癌中超過一半的患者是攜帶EGFR和ALK兩個突變之一，這種方案性價比較高。所以，如果患者屬于肺腺癌，而且經(jīng)濟條件一般，把有限的錢用在刀刃上才是更合理的。

2、全基因檢測：同時檢測幾十個甚至上百個癌癥相關(guān)基因，比如，F(xiàn)DA批準的首款獲得突破性認定的癌癥NGS體外診斷檢測產(chǎn)品--FoundationOne CDx (F1CDx)可檢測324個基因的突變，還可以檢測TMB和MSI兩個基因組特征。

優(yōu)勢：使用新一代測序技術(shù)，最大優(yōu)勢是覆蓋面大，一次就能綜合了解情況，但它目前比第一種方案昂貴。當然，隨著新測序技術(shù)越來越便宜，最終第一個方案肯定會被取代，但目前，還是二者共存。

3、多平臺分子分析：傳統(tǒng)基因檢測實際受益的患者不到10%!美國凱瑞思精準生命科學(xué)公司是全球領(lǐng)先的分子科學(xué)創(chuàng)新者，不單單提供靶向治療選擇，而是通過全基因檢測+ 多平臺分子檢測服務(wù)，同時從DNA、RNA和蛋白質(zhì)三大層面(一般的二代測序僅基于DNA)，揭示每位癌癥患者的分子藍圖，全面分析用藥方案，精準的為臨床醫(yī)生及患者呈現(xiàn)化療、靶向治療及免疫治療藥物在內(nèi)的所有治療選擇!

優(yōu)勢：是目前最全面的精準檢測項目，幫助臨床醫(yī)生和患者找到所有潛在的臨床有效藥物，避免采用無效的藥物。

全球腫瘤醫(yī)生網(wǎng)提醒大家，每個病人，其實都要綜合腫瘤的種類、疾病的分期、之前治療的情況、后續(xù)治療的愿望、以及家庭經(jīng)濟承受能力，做一個“個性化”的安排，歡迎大家來咨詢?nèi)蚰[瘤醫(yī)生網(wǎng)醫(yī)學(xué)部的相關(guān)專家。

基因檢測用什么樣品做?

做基因檢測，是檢測腫瘤細胞的突變，因此需要獲取腫瘤細胞。

臨床上通常有三種方式：

1. 肺癌手術(shù)中(或胸水中)得到腫瘤樣品。

2. 穿刺活檢樣品，通常是在局部麻醉下，使用很細的針刺入疑似腫瘤，來獲取少量細胞用于分析。這樣創(chuàng)傷很小，可以避免不必要的手術(shù)，對患者影響小。

3. “液體活檢”。肺癌的液體活檢，主要是指通過分析血液里的癌細胞或者癌細胞釋放的DNA進行分析，判斷癌癥突變類型。這之所以能成功，是因為晚期癌細胞，或者癌細胞的DNA，會經(jīng)常跑到血液里面，現(xiàn)代技術(shù)有可能把它們捕獲，進行分析。

“液體活檢”是目前最熱門的技術(shù)之一，最大的優(yōu)點是無創(chuàng)，風險小，而且可以反復(fù)多次取樣，但目前依然以組織病理切片的基因檢測，準確度最高，是業(yè)內(nèi)公認的金標準。雖然它也不是100%完美(比如還有空間、時間、異質(zhì)性的問題)。但是，常常能遇到病友無法取得足夠的組織，或者組織標本年代久遠，這類情況下，也可以考慮用血液標本勉強代替。我們一般推薦的優(yōu)劣順序是：最近手術(shù)或活檢新取的組織標本>1-2年內(nèi)的組織標本>最新的血標本>2年以上的舊的組織標本。

癌癥患者一定要做基因檢測嗎?

廣義上講，所有腫瘤患者均可以接受基因檢測;狹義上講，根據(jù)指南推薦，不同的病種、不同的分期、出于不同的目的，不同的患者，適合做不同的基因檢測。

比如，一個晚期肺腺癌患者，尚未接受任何治療，家庭經(jīng)濟情況一般，只是為了看看，是否有合適的已經(jīng)在內(nèi)地上市的靶向藥可用，那么只要測一下最常見的那幾個基因就可以了。

比如，一個超級土豪，是一個肉瘤，其他藥物治療都失敗了，但是依然想碰碰運氣，看看是不是自己還有靶向藥可用：不管是已經(jīng)上市還是處于臨床試驗研究階段的，不管是國內(nèi)還是國外，都想知道。那么，他或許可以選擇做一下跨癌種的、盡可能多的、幾十上百甚至全部的基因。

但是，在癌癥的治療過程當中，有一部分人在接受靶向治療前，選擇不做基因檢測，而這種治療方法就叫做盲試。對比基因檢測，盲試也有自己的優(yōu)勢，比如即能省錢又能節(jié)省時間。那么到底什么情況才可以跳過基因檢測，直接進行靶向治療呢?

1、靶向藥單一：一些種類的癌癥，可能突變類型比較單一，對于靶向藥也沒有可選余地，這種情況下，可以選擇盲試，一旦發(fā)現(xiàn)沒有效果，就需要更他療法。

2、生存期不樂觀：對于一些癌癥友友，可能醫(yī)生的預(yù)估不足6個月，并且經(jīng)濟條件也不好，這種情況，如果拿半個月等一個不確定的結(jié)果的話，就顯得太冒險，所以不如直接進行盲試，把錢用在刀刃上，挑選概率最大的進行嘗試，俗稱“闖大運”。

當然盲試也有著自己的短板，在沒有基因檢測之前，用藥基本靠“猜”，而效果也基本靠“祈禱”，所以在治療的過程中，對于是否進行靶向治療，大家可以在咨詢主治醫(yī)生或腫瘤患者權(quán)威的服務(wù)平臺全球腫瘤醫(yī)生網(wǎng)后慎重決定。下面我們還會介紹國內(nèi)外權(quán)威的基因檢測公司排名，目前獲批的靶向藥物列表等癌癥患者關(guān)心的問題，感興趣的患者可以關(guān)注微信號第一時間獲得最新消息。